PERBANDINGAN KUANTITAS DAN KUALITAS ISOLAT DNA Aspergillus niger MENGGUNAKAN FILTER BASED KIT, ALKALINE LYSIS DAN HEAT TREATMENT

Show simple item record

dc.contributor.author Barqly, Hizb Hamzah Al Kahfi
dc.date.accessioned 2021-12-08T07:22:17Z
dc.date.available 2021-12-08T07:22:17Z
dc.date.issued 2021-10-14
dc.identifier.uri http://repository.unisma.ac.id/handle/123456789/2707
dc.description.abstract Pendahuluan: Aspergillus niger (A. niger) penyebab Chronic Pulmonary Aspergillosis (CPA) yang deteksinya dengan kultur membutuhkan waktu yang lama. Metode deteksi cepat dengan PCR memerlukan isolat DNA dengan kuantitas dan kualitas yang memadai dan umumnya diperoleh dengan ifilter based kit (FBK). Metodeiisolasi DNAi yang sederhana, mudah dan murah perlu dikembangkan, namun analisa perbandingannya belum ada sehingga perlu dilakukan. Metode: Penelitian eksperimental in vitro dengan A. niger yang dikuantifikasi dengan haemocytometer. Sampel jumlah selnya 109, 104 sel/ml dan kontrol normal saline (NS). Isolasi DNA dilakukan dengan metode heat treatment (HT), alkaline lysis (AL) dan FBK. Hasil isolat DNA dilakukan perhitungan kuantitas dan kualitas DNA dengan spektrofotometer nanodrop. Data dianalisis dengan One Way ANOVA, LSD, Kruskal Wallis, dan Mann Whitney (p<0,05). Hasil: Pada 109 sel/ml, urutan peroleh kuantitas DNA dari terbaik ke terburuk (p<0,05) adalah HT>FBK>AL (194,8 – 10,6 μg/ml), sedangkan untuk kualitas A260/280 (p<0,05) adalah AL>FBK>HT dengan rentang (1,80 – 1,26), dan kualitas A260/230 (p<0,05) adalah AL>HT>FBK (0,85 – 0,32). Pada jumlah sel 104 sel/ml, urutan kuantitas DNA (p<0,05) adalah HT>FBK>AL (12,8 – 0,2 μg/ml), sedangkan untuk kualitas A260/280 (p>0,05) adalah FBK=HT=AL (1,90 – 1,50), dan kualitas A260/230 (p<0,05) adalah HT>FBK>AL (0,46 – 0,02). Pada NS, urutan perolehan kuantitas secara signifikan adalah HT>FBK=AL (4 – 0 μg/ml), dengan tidak ada perbedaan kualitas A260/280, namun untuk kualiats A260/230 (p<0,05) adalah HT>FBK=AL (0,59 – 0). Kesimpulan: Kuantitas DNA terbaik pada konsentrasi 109 dan 104 sel/ml adalah metode HT, sedangkan kualitas DNA terbaik pada konsentrasi 109 sel/ml adalah pada metode AL dan pada konsentrasi 104 sel/ml adalah FBK. en_US
dc.language.iso other en_US
dc.publisher Universitas Islam Malang en_US
dc.subject Aspergillus niger en_US
dc.subject Filter Based Kit en_US
dc.title PERBANDINGAN KUANTITAS DAN KUALITAS ISOLAT DNA Aspergillus niger MENGGUNAKAN FILTER BASED KIT, ALKALINE LYSIS DAN HEAT TREATMENT en_US
dc.type Other en_US


Files in this item

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Kolom Pencarian


Browse

My Account