Penerapan protokol kesehatan sangat penting diterapkan di era new normal seperti saat ini, dikarenakan hampir diseluruh belahan dunia termasuk di Indonesia terdapat wabah atau virus penyakit yang keberadaanya mengancam kesehatan masyarakat dengan penularan yang sangat cepat. Virus ini dikenal dengan istilah Covid-19. Virus Corona dapat dengan mudah menyebar dan menginfeksi siapapun tanpa memandang usia, termasuk pada Anak Usia Dini. Hal ini menuntut masyarakat terutama anak-anak harus memahami pentingnya menerapkan protokol kesehatan di tengah kegiatan sehari-hari, baik di tempat umum atau disekolah selama masa pandemi Covid-19. Anak-anak perlu diberikan pengetahuan tentang hal-hal yang berkaitan dengan protokol kesehatan, seperti: pentingnya penggunaan masker, handsanitizer, social distancing, cuci tangan dan lain sebagainya. Kebiasaan-kebiasaan tersebut perlu diajarkan, diterapkan dan dilatih sejak dini sehingga anak bisa beradaptasi dengan situasi new normal dan melakukan aktivitas secara aman dan terjaga dari penularan Covid-19. Penelitian ini bertujuan untuk : 1) Mengetahui tentang kondisi kedisiplinan siswa terhadap protokol kesehatan Covid-19, 2) Mengetahui penerapan protokol kesehatan yang dilakukan pihak sekolah, 3) Mengetahui kendala selama penerapan protokol kesehatan pada siswa di RA Muslimat NU 15 Malang. Pendekatan yang digunakan dalam penelitian ini adalah penelitian kualitatif dengan jenis studi kasus, dalam penelitian ini peneliti melaksanakan pengkajian data secara deskriptif yang dituangkan dalam bentuk laporan dan uraian. Penelitian yang dilakukan di RA Muslimat NU 15 Malang menggunakan tiga teknik pengumpulan data yakni metode observasi, wawancara dan dokumentasi. Selain itu teknik analisis data dilakukan mereduksi data, penyajian data, dan penarikan kesimpulan. Sedangkan pengecekan keabsahan data diambil dengan perpanjangan pengamatan, pembahasan sejawat, dan triangulasi. Hasil penelitian ini menunjukan kondisi kedisiplinan siswa di RA Muslimat NU 15 Malang terhadap protokol kesehatan dikatakan cukup baik, dapat dilihat dari siswa yang mengenakan masker membawa handsanitizer ketika disekolah. Berdasarkan hasil penelitian, mengenai upaya penerapan yang telah dilakukan pihak sekolah dalam mendukung disiplin protokol kesehatan Covid-19 diantaranya: a) menghindari kerumunan sehingga pembelajaran dilakukan secara daring b) pembagian alat kesehatan c) guru wajib memberi contoh kepada siswa dengan tetap menerapkan protokol kesehatan di lingkungan sekolah d) pihak sekolah memberikan fasilitas dan sarana penunjang penerapan protokol kesehatan e) melakukan sosialisasi edukasi Covid-19. Selama penerapan protokol kesehatan pada siswa tidak lepas dari kendala itu sendiri, dari penelitian ini ditemukan kendala tersebut diantaranya: a) datang dari lingkungan sekitar b) dalam diri siswa sendiri c) guru kurang menekankan peraturan penerapan protokol kesehatan disekolah d) kendala yang dialami guru yaitu kurangnya tenaga pegawai disekolah membuat fasilitas yang disediakan tidak digunakan. Hal yang perlu diperhatikan sebagai saran-saran yaitu sekolah sebaiknya lebih menekankan adanya peraturan terakit penerapan protokol kesehatan Covid-19 di lingkungan sekolah agar banyak siswa yang disiplin menerapkan protokol kesehatan sehingga aktivitas disekolah berjalan secara aman dan terjaga. Selain itu sebaiknya pihak sekolah dapat menambah tenaga pegawai selama era new normal, agar fasilitas yang disediakan sekolah dapat digunakan secara maksimal. Kata Kunci : Protokol Kesehatan, Kedisiplinan, Anak Usia Dini, Covid-19