Pandemi Covid-19 berdampak negatif pada berbagai aspek kehidupan termasuk bidang pendidikan tinggi. Dalam upaya memutus rantai Covid-19 pemerintah mengeluarkan kebijakan bahwa pelaksanaan kegiatan Universitas Wiraraja Madura dilakukan secara online dengan konsep work from home (WFH). Kehadiran work from home (WFH) menimbulkan pro dan kontra di kalangan akademisi. Tujuan penelitian ini untuk menganalisis peran motivasi kerja dan kinerja pada pengaruh implementasi Work from Home (WFH) terhadap kepuasan kerja. Populasi penelitian ini adalah karyawan dan dosen Universitas Wiraraja Madura yang berjumlah 264 dan diambil seluruhnya sebagai responden penelitian. Metode analisis datanya adalah kuantitatif. Teknik analisis yang digunakan adalah SmartPLS. Hasil penelitian ini memberikan gambaran tentang konsep bekerja dari rumah dalam bidang pendidikan khususnya perguruan tinggi hanya dapat melaksanakan pengajaran yang dilakukan secara online. Hasil penelitian menunjukkan bahwa, Work From Home (WFH) berpengaruh signifikan terhadap kepuasan kerja, motivasi dan kinerja. Motivasi kerja dan kinerja berpengaruh signifikan terhadap kepuasan kerja. Selanjutnya motivasi dan kinerja mampu memediasi pengaruh Work From Home (WFH) terhadap kepuasan kerja.Kegiatan kerja lainnya yang terkait dengan pelayanan akademik masih dilakukan dengan work from home (WFH) dan setiap kegiatan dipantau secara berkala.