Potensi Anti Bakteri Senyawa Aktif Alga Hijau (Cladophora sp.) dalam Menghambat Penicillin Binding Protein Staphylococcus aureus Pendekatan Moleckular Docking

Abstract

Riza Ma’rufin. Fakultas Kedokteran, Universitas Islam Malang, 2022. STUDI INSILICO POTENSI ANTIBAKTERI SENYAWA AKTIF ALGA HIJAU (Cladophora Sp.) DALAM MENGHAMBAT Penicilin Binding Protein 2 dan 2a Staphylococcus aureus. Pembimbing 1: Yoni Rina Bintari. Pembimbing 2: Rio Risandiasyah

Pendahuluan: Resistensi antibiotik terhadap S. aureus meningkat akibat mutasi Penicillin Binding Protein (PBP) 2 menjadi Penicillin Binding Protein (PBP) 2a. Sehingga dilalukan pencarian antibiotik baru. Cladophora sp. mengandung senyawa antibakteri, tapi belum diketahui mekanisme dan potensinya. Penelitian ini memprediksi potensi senyawa aktif Cladophora sp. terhadap PBP2 dan PBP2a serta prediksi farmakokinetik dan fisikokimia.

Metode: Penambatan senyawa aktif Cladophora sp. terhadap protein target menggunakan docking server. Profil fisikokimia dan farmakokinetik melalui web pkCSM. Analisa data dilakukan secara deskriptif analitik.

Hasil: Penambatan kontrol dengan PBP2 memiliki binding affinity -5.03 kcal/mol. Myrtenal, Myristic acid, Deca-2,4-dienal berpotensi lebih baik dibanding kontrol, nilainya -6.04 kcal/mol, -5.96 kcal/mol, -5.08 kcal/mol. Myrtenal memiliki kesamaan titik seperti kontrol di PRO103, LEU219, Myristic acid LEU221, Deca-2,4-dienal SER105 LEU221. Penambatan kontrol PBP2a memiliki binding affinity -5.16 kcal/mol. Myristic acid, Deca-2,4-dienal, 2-methylphenol berpotensi lebih baik dibanding kontrol, nilainya -7.28 kcal/mol, -6.66 kcal/mol, -5.32 kcal/mol. Myristic acid dan 2-methylphenol memiliki kesamaan titik seperti kontrol di ikatan ASN57. Senyawa aktif Cladophora sp. yang memenuhi kriteria fisikokimia dan farmakokinetik adalah Myrtenal, Myristic acid, Deca-2,4-dienal, Deca-2,4-dienal, 2-methylphenol. Senyawa Cladophora sp. memiliki profil farmakokinetik yang berpotensi kandidat antibakteri.

Kesimpulan: Senyawa penghambat PBP2 adalah Myrtenal, Myristic acid Senyawa penghambat PBP2a adalah Myristic acid, Deca-2,4-dienal, 2-methylphenol. Semua enyawa memenuhi Lipinski dan ADMET.

Kata Kunci : Cladophora sp., Amoxicillin Clavulanate, PBP2a.