Sumber air di Situs Patirtaan Ngawonggo berdekatan dengan lahan pertanian dan berada satu aliran dengan aliran sungai. Sumber mata air tersebut dimanfaatkan oleh masyarakat sekitar untuk memenuhi kebutuhan air bersih seperti keperluan air minum. Aktivitas domestik dan pertanian masyarakat di sekitar yang semakin meningkat akan berdampak pada penurunan kualitas air. Penelitian mempelajari mengenai kualitas air dengan berdasarkan beberapa parameter yaitu parameter fisik (suhu, kekeruhan dan konduktivitas), kimia (pH), dan mikrobiologi metode MPN dan penguatan dengan BGLB pada suhu (44±0,5)°C untuk mengetahui kelayakan dari mata air tersebut sebagai air minum. Hasil pengujian rata-rata dibandingkan dengan standar baku mutu dalam Peraturan Menteri Kesehatan RI No. 492/MENKES/PER/IV/2010 pada parameter pH dan kekeruhan air antar lokasi dianalisis menggunakan uji statistik. Didapatkan nilai asymtotic significance (Asymp. Sig.) (2-tailed) ˃ 0,05 yang berarti nilai rata-rata parameter pH dan kekeruhan antar sumber tidak terdapat perbedaan. Hasil menunjukkan kualitas sumber air di Situs Patirtaan Ngawonggo berdasarkan parameter fisik-kimia berada pada kadar yang diperbolehkan sedangkan pada parameter mikrobiologi tidak memenuhi baku mutu air minum dengan nilai melebihi 0 koloni/100 ml untuk bakteri Coliform dan Escherichia coli fekal.