Setiap aktivitas manusia pada umumnya menghasilkan limbah buangan yang dipengaruhi oleh jumlah penduduk dan itu semakin meningkat dari tahun ke tahun. Dengan tingginya jumlah penduduk Kota Malang, maka semakin tinggi pula limbah domestik yang dihasilkan oleh masyarakat termasuk limbah tinja. Salah satu upaya pemerintah dalam meningkatkan pengolahan limbah tinja agar layak dibuang ke lingkungan adalah dengan penyediaan sarana Instalasi Pengolahan Lumpur Tinja (IPLT). Air Limbah tinja umumnya mengandung banyak bakteri atau mikroorganisme seperti bakteri patogen penyebab penyakit. Penelitian ini bertujuan untuk membandingkan jumlah bakteri patogen yang terdapat pada kolam fakultatif 4 dan maturasi di IPLT Supit Urang. Jenis penelitian adalah penelitian kuantitatif observasional dengan pendekatan deskriptif. Sampel penelitian diambil pada bagian tengah pada masing masing kolam. Identifikasi bakteri patogen di dilakukan dengan pengamatan makroskopis dan mikroskopis, sedangkan penentuan jumlah koloni dilakukan dengan media EMBA dan dihitung total menggunakan colony counter selanjutnya dianalisis dengan Uji t untuk melihat berbedaan jumlah bakteri yang teridentifikasi antar 2 kolam. Hasil penelitian menunjukkan terjadi penurunan jumlah koloni bakteri yang ditemukan pada kolam fakultatif 4 dan kolam maturasi dan hasil Uji t pada jumlah koloni antar kolam didapatkan nilai 0,017709 (< 0,05) hal ini menunjukkan terdapat perbedaan jumlah bakteri patogen yang signifikan pada kolam fakultatif 4 dan maturasi di IPLT Supit Urang kota Malang. Adapun bakteri patogen yang teridentifikasi pada kolam fakultatif 4 dan maturasi terdiri dari 5 genus yang merupakan famili dari Enterobacteriaceae yaitu : Eschercia coli, Shigella, Salmonella, Enterobacter dan Klabsiella.