Prediksi Mekanisme Anti Thrombin Dari Senyawa Fitokimia Daun Sirsak (Annona Muricata) Melalui Penghambatan Protein Thrombin Dan Human Vkor Dengan Studi In Silico

Abstract

Pendahuluan: Stroke merupakan penyakit tidak menular yang dapat disebabkan karena adanya thrombus pada pembuluh darah otak. Daun sirsak diketahui memiliki potensi sebagai trombolitik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui afinitas senyawa aktif daun sirsak sebagai anti thrombin melalui mekanisme inhibisi protein thrombin dan enzim human VKOR secara in silico.

Metode: Proses docking molekuler antara senyawa aktif daun sirsak dengan protein thrombin (kode:1ZGI) dan protein human VKOR (kode:6WV6). Senyawa aktif diperoleh melalui literatur dan website Dr. Duke, kemudian dilakukan skrining menggunakan website PASS online. Proses docking menggunakan aplikasi pyrx. Prediksi sifat fisikokimia dan farmakokinetik menggunakan website pkCSM. Analisis data menggunakan deskriptif analitik dengan indikator penilaiannya energi ikatan bebas dan residu asam amino yang dibandingkan dengan kontrol.

Hasil: Dari 22 senyawa yang memiliki nilai Pa (probability activity) >0,5 didapatkan hasil docking senyawa terbaik dari protein thrombin yaitu procyanidin ∆G-9.5kkal/mol;45%, muricinine ∆G-7.5kkal/mol;36%, reticuline ∆G-7.4kkal/mol;45%, dibandingkan control oxazolopyridinine inhibitor 21 ∆G -10.1kkal/mol. Hasil doking senyawa terbaik dari protein human VKOR yaitu muricinine ∆G-9.3kkal/mol;75%, coclaurine ∆G-8.9kkal/mol;87%, procyanidin ∆G-7.9kkal/mol;62% dibandingkan kontrol phenindione ∆G-9.9kkal/mol. Prediksi fisikokimia coclaurine, reticuline dan muricinine memenuhi aturan Lipinski. Hasil prediksi farmakokinetik reticuline dan coclaurine mempunyai farmakokinetik yang baik namun bersifat hepatotoksik.

Kesimpulan: Reticuline dan coclaurine diprediksi berpotensi menghambat protein thrombin dan human VKOR, namun diprediksi mempunyai efek hepatotoksik, sehingga pemberian dalam jangka panjang masih perlu dikaji lebih lanjut.

Kata Kunci: Trombolitik, Anti Thrombin Annona muricata; in silico.